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1990年启动的人类基因组计划，与曼哈顿原子弹计划和阿波罗计划并称为三大科学计划，可见基因组计划的重要性。今天，“云菌”基因组研究计划也在悄然进行，研究人员已为94种野生菌做了基因组测序，还将建立一个基因组数据库。
云南食用菌资源丰富，我国记载有930余种，在云南分布的就有670余种(占全国的74%以上)，市场上常见的贸易类群有200种。公认的著名野生食用菌，云南都有分布，如松茸、块菌、羊肚菌、牛肝菌、鸡公式菌、鸡油菌、松乳菇等。
“云菌”不仅仅是餐桌上的美味，更是推动当地经济的一大原动力。但乱采乱挖、过度采集现象十分普遍，生态环境出现退化，资源储量和商业产量均呈下降趋势，部分品种临近濒危。
云南农业大学和云南省高原特色农业产业研究院在盛军校长的带领下，联合四川省农科院、中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所，于2015年启动了“ 云菌 基因组研究计划”，计划对100种野生菌进行基因组测序，并建立数据库。
云南农业大学、云南省高原特色农业产业研究院教授马啸说，对云南食用菌进行基因组解析，可以了解食用菌生长、发育和繁衍的内在机理;揭示食用菌营养成分合成的过程;阐明食用菌的安全性和营养性;进行食用菌品种鉴定，获得食用菌领域的“话语权”。助推食用菌产业发展。
目前，项目已进入收尾攻坚阶段，研究人员已经组装好94种野生菌的基因组，因野生菌种类较多，基因组大小差异较大，大部分在30～80MB左右，少数几个达到100MB以上，项目团队通过优化调配资源，各项工作均在有序推进之中。
